SARS CoV-2 的快速病毒突变导致在这些突变出现之前开发的疫苗的功效下降。因此，人们认为，采取额外措施来对抗病毒不仅是可取的，而且是有益的。有两种抗病毒药物被FDA批准紧急使用，即Paxlovid帕克洛维和Lagevrio (molnupiravir,莫努匹拉韦) 。Paxlovid帕克洛维是两种药物组合，包括 nirmatrelvir，一种阻断冠状病毒繁殖能力的蛋白酶抑制剂，以及另一种抗病毒药物，ritonavir，它降低了药物清除率，以延长蛋白酶抑制剂的寿命和活性。 Lagevrio (molnupiravir,莫努匹拉韦) 是一种核苷类似物，其作用机制旨在将错误引入病毒的遗传密码中。
另外，还可以通过添加病毒存活及其复制能力所需的另一类酶抑制剂来增强抗病毒能力。像 nsp14 和 nsp10/16 甲基转移酶 (MTases) 这样的酶代表了另一类药物靶标，因为它们是病毒 RNA 翻译和逃避宿主免疫系统所必需的。
科学家们验证了 MTase-Glo 是一种通用且均相的 MTase 检测方法，可用于筛选 SARS CoV-2 的两种关键酶 nsp14 和 nsp16 的抑制剂。
Lagevrio（Molnupiravir莫诺匹韦）未在中国上市，不过已在孟加拉被成功仿制。
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