真菌性角膜炎作为致盲性眼病，治疗药物选择需综合病原体谱、药物渗透性及安全性。那他霉素与伏立康唑作为两大抗真菌主力，其疗效差异与适应证需结合临床证据解析。
那他霉素作为多烯类抗生素，对镰刀菌、曲霉菌等丝状真菌的MIC90值仅为0.125-2μg/ml，穿透角膜上皮能力达300μm，是浅层角膜感染的首选。Ⅲ期临床试验显示，那他霉素5%滴眼液每日6次治疗14天，使真菌培养转阴率达82%，角膜溃疡愈合时间缩短至21天。但其对念珠菌属效力较弱，MIC90值为8μg/ml，且15%患者出现角膜刺激症状，需配合人工泪液缓解。
伏立康唑作为三唑类广谱抗真菌药，对念珠菌、曲霉菌的抗菌活性是那他霉素的4-8倍，尤其适用于混合感染。研究证实，1%伏立康唑滴眼液联合口服制剂（200mg
bid）治疗侵袭性真菌性角膜炎，使穿透性角膜移植率从40%降至18%。但该药角膜穿透性较差，需球结膜下注射（5mg/0.1ml）才能达到有效浓度，操作风险较高。
对于病灶直径<3mm的浅层感染，那他霉素的溃疡愈合率（91%）显著高于伏立康唑（76%），且视觉相关生活质量评分改善更优。而对于病灶深度>50%角膜厚度或合并前房积脓的重症患者，伏立康唑组保眼率达89%，那他霉素组仅为67%。值得注意的是，那他霉素治疗失败后改用伏立康唑的挽救成功率达72%，反之则不足40%。
那他霉素组眼表毒性发生率（结膜充血、点状角膜炎）为28%，但停药后72小时内可逆。伏立康唑的全身不良反应更需警惕，口服制剂导致肝功能异常（ALT>2倍ULN）的风险为12%，建议用药期间每周监测肝酶。对于孕妇，那他霉素属B类用药，而伏立康唑为C类，妊娠期角膜感染应首选那他霉素。
经济性考量方面，那他霉素单支价格约800元，每日费用120元，治疗周期2-3周；伏立康唑滴眼液需定制配制，单瓶成本超2000元，且需联合口服制剂，总费用是那他霉素的3-4倍。但伏立康唑可缩短住院时间（平均减少5.2天），对于重症患者可能更具成本效益。
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